养殖废水的水质特点是含有各类有机物质、粪便和砂土等污染物。此类废水采用生化+物化处理相结合的方法能达到很好的处理效果。
养殖废水由养猪场出来后流经格栅、微滤机，经格栅、微滤机除去大部分体积较大的杂物后，进入厌氧池。在厌氧池内，有机物在厌氧条件下进行水解，由生物难降解的高分子有机物转变成生物易降解的小分子有机物，以便后续工艺处理。厌氧池产生一定量的沼气，由沼气收集设备回收利用（本方案未设计沼气手机系统）。
养殖废水由厌氧池出来后自流入调节池。调节池内设置嚗气搅拌管网，定时对调节池进行嚗气搅拌，以防止调节池内悬浮物沉淀下来及加强混合效果。
养殖废水处理工艺流程框图：
养殖废水在调节池内进行水质水量均衡后，由提升泵送入酸化水解池，酸化水解池采用升流式厌氧污泥反应床形式，污水由下而上穿过池中由微生物所形成的污泥床，废水中污染物（有机物）被污泥床所截留，经吸附、消化和分解，将高分子，复杂的有机物分解成低分子、简单的有机物，如有机酸等到。同时，由接触氧化池回流至此的混合液在此反硝化菌作用下进行反硝化，达到生物脱氮目的。
污水由酸化水解池出来后进入接触氧化池。接触氧化池内悬挂大量的组合填料，填料表面附着大量的好氧微生物，在有氧的条件下同化和分解水中的有机物（污染物），最终生成CO2和H2O；同时，聚磷菌将污水中大量的磷摄入体内，同老化的生物膜随水流入二沉池。接触氧化处理系统分为二级，可以为不同的优势菌种提供不同的生存条件，可以提高接触氧化池的处理效率。
污水由接触氧化池出来后进入二沉池，同时加入除磷剂，污水中磷酸盐和含磷微生物絮凝沉淀在二沉池集泥斗中，然后由污泥泵送入水解酸化池。
废水由二沉池出来后自流入消毒池，加入消毒剂漂水，杀死废水中绝大部分细菌后由砂滤泵抽入砂滤塔和炭滤塔，反冲水进入调节池重新处理，炭滤塔出水可以达标排放或回用于猪舍。